固體飲料滅菌是使藥液經過專用的無菌過濾器，除去活的或死的微生物，得到無微生物的濾液。適用于耐高溫液體藥品的滅菌。細菌過濾器。固體飲料滅菌能有效去除溶液中的微生物，溶液能順利通過過濾器，不會有不必要的物質落入濾液中。過濾器易于清潔和操作。
孢子大小不超過0.5μm。因此，對于具有篩分效果的過濾器，如纖維素酯膜過濾器。孔徑大，秘密晶須小到足以阻止細胞和芽進入過濾孔，大約0.2μM。過濾器的直徑可以略大于保留在孔中的過濾器或通過靜電作用過濾的顆粒的直徑。但是，如果壓力太大或波動過大，顆粒可能會被擠壓通過。應檢查過濾器的孔徑。常用的測定孔徑的方法是用0.7μM左右的雙歧桿菌懸浮液過濾，濾液培養后觀察是否有耐寒植物。
近年來，微孔膜被廣泛用作殺菌過濾器。關于膜過濾器的性能，請參考注射劑一章中過濾器的種類和選擇。殺菌過濾一般采用孔徑為0.22μm的濾膜。G6立式熔融玻璃漏斗過濾孔直徑小于2μm，可去除細菌，不吸附藥物，不影響藥液pH值。過濾器經常消毒。此外，孔徑為0.8-1.8μm的石棉板過濾器和孔徑為1.5-1.7μm的粘土濾柱也可用于過濾細菌。但是，由于它們的缺點，在實踐中很少使用。
輻射滅菌是γ射線滅菌的一種方法。伽馬射線通常是由放射性同位素如Co60產生的。輻射滅菌的特點是不能提高產品的溫度。用于一些耐熱滅菌，滲透性強。伽瑪射線適用于較厚樣品的滅菌。已成功應用于維生素、抗生素、激素、肝素、腸線、醫療器械等物質的滅菌。包裝好的產品也可以消毒，大大減少了污染的機會。
輻射滅菌，設備成本高，有些藥品經過輻射滅菌后，可能會降低療效，產生有毒物質或發熱物質，而且溶液的穩定性不如固體，同時要注意充分防護。