固體飲料滅菌微波萃取（MAE）是一種利用電磁場將固體或半固態材料中的有機物從基體中有效分離出來，并保持分析對象原有的化合物狀態的一種分離方法。微波是指頻率在300兆赫至300兆赫之間的電磁波。

固體飲料滅菌微波萃取的機理可以從以下三個方面進行分析

① 微波輻射是高頻電磁波穿透萃取介質，到達物質內部的微管和腺體系統的過程。由于吸收了微波能量，電池內的溫度會迅速上升，使電池內的壓力超過了細胞壁膨脹的能力。結果，細胞破裂，其中的活性成分自由流出，在較低的溫度下溶解在萃取介質中。通過進一步過濾和分離，可以得到所需的提取物。

② 微波產生的電磁場可以加速萃取組分分子從固體到固液界面的擴散速率。例如，當水作為溶劑時，在微波場的作用下，水分子從高速旋轉狀態轉變為激發態，這是一種高能量的不穩定狀態。此時，水分子要么蒸發以增強提取成分的驅動力，要么將自身多余的能量釋放回基態。釋放出來的能量將傳遞給其他物質的分子，加速它們的熱運動，從而縮短萃取組分分子從固體向固液界面擴散的時間。結果表明，提取率可提高數倍，并可降低提取溫度，以保證提取物的質量。

③ 由于微波的頻率與分子的旋轉頻率有關，微波能是一種由離子遷移和偶極子旋轉引起的非電離輻射能。當它作用于分子時，能促進分子的旋轉運動。如果分子具有一定的極性，在微波場的作用下會產生瞬時極化，并以24.5億次/秒的速度發生極性變化，并迅速產生大量的熱能，使細胞破裂，細胞液溢出擴散到溶劑中。在微波萃取中，微波吸收能力的差異會使萃取體系中的基體材料或某些組分的某些區域被選擇性加熱，使提取的物質從基體或體系中分離，進入介電常數低、微波吸收能力相對較差的萃取溶劑中。